Pri dolgotrajni uporabi računalnika se podatki na njem razdrobijo. Defragmentacija odpravi to pomanjkljivost, pomaga izboljšati delovanje računalnika in podaljša življenjsko dobo pogonov.
Če uporabnik veliko spremeni datoteko, ki je v uporabi, prostor na disku, dodeljen zanjo, morda ne bo zadosten. Nato se podatki zapišejo v kosih. Podobna situacija se zgodi pri zapisovanju velikih datotek na skoraj poln disk. Ko je na disku malo praznega prostora, se vanj zapišejo vsi novi podatki v poljuben prosti prostor. Zdi se, da so datoteke raztrgane na več delov, ki se nahajajo na različnih delih diska. Če se postopki brisanja in zapisovanja podatkov pojavljajo dovolj pogosto, potem večina diska postane fragmentirana. To znatno zmanjša zmogljivost operacijskega sistema, čas dostopa do datotek in čas zagona programa. Vse te neprijetne posledice lahko preprečite z zagonom postopka defragmentacije diska. Posledično se datoteka zbere v eno celoto, podatki se shranijo na začetku diska, na koncu pa ostane prosti prostor, kar poveča tudi hitrost dostopa do datotek in map. Z redno defragmentacijo se bo življenjska doba diska povečala, saj bralna glava bistveno manj premika. Lahko defragmentirate s posebnimi programi. V operacijski sistem je običajno vgrajen program za ta postopek. Če ga želite uporabiti, v oknu "Moj računalnik" z desno miškino tipko kliknite disk, na katerem želite defragmentirati, in v meniju "Orodja" izberite "izvedite defragmentacijo". Nato boste videli okno programa, kjer lahko najprej izberete, da analizirate disk glede stopnje razdrobljenosti in nato izvedete potrebna dejanja. Na voljo je veliko komercialnih programov za defragmentacijo. Postopek izvajajo bolj temeljito, postopek je mogoče zagnati v ozadju in po določenem urniku. Toda za povprečnega uporabnika je vgrajeni program za defragmentacijo pogosto dovolj.