Total Commander je priljubljen program, ki je sloves pridobil zaradi enostavnosti uporabe, velikega števila vtičnikov in prisotnosti edinstvenih nastavitev, ki niso na voljo v večini drugih upraviteljev datotek. Kljub temu ima Total Commander številne alternativne programe, ki nimajo nič manj funkcionalnosti in so lahko dobra zamenjava.
FAR Manager
Ena izmed najbolj priljubljenih alternativ Total Commanderju je FAR Manager. Ta program ima podoben nabor funkcij, vendar se razlikuje po vmesniku in nekaterih funkcijah. Tako kot Total Commander ima tudi aplikacija na voljo veliko število vtičnikov, ki bodo pripomogli k izboljšanju funkcionalnosti tudi najzahtevnejših uporabnikov. Glede nabora možnosti FAR ne zaostaja za svojim sogovornikom, je popolnoma brezplačen in ga skupnost programerjev aktivno razvija. FAR ima podoben dvostranski vmesnik, izveden v besedilni obliki, zaradi česar je upravitelj datotek enostaven za uporabo in hiter za uporabo tudi v šibkih računalnikih.
FAR ima tudi teme, funkcije programa pa lahko v celoti nadzorujete s tipkovnice.
FreeCommander
FreeCommander je brezplačna alternativa Total Commanderju. Tako kot njegov predhodnik ima tudi FreeCommander večjezični prilagodljiv vmesnik in širok spekter nastavitev. Značilnost programa je zmožnost zagnati bliskovni pogon kot prenosno različico v katerem koli sistemu Windows. Aplikacija je hitra, ima možnost ogleda arhivov v navadnem besedilu ter v šestnajstiški in binarni obliki. Za razliko od FAR pripomoček podpira povleci in spusti in se lahko poveže z oddaljenimi strežniki FTP. FreeCommander lahko postane popolna alternativa Total Commanderju.
Pomanjkljivost FreeCommanderja je pomanjkanje sistema modulov in zmožnost integracije lastnih razširitev.
Imenik Opus
Directory Opus je plačljiv upravitelj datotek z večnamenskim vmesnikom, ki bo dober pomočnik pri delu z različnimi datotekami. Tako kot Total Commander ima tudi aplikacija večjezični vmesnik, možnost spreminjanja zasnove z nekaj gumbi. Program ima naprednejšo funkcijo filtriranja in iskanja datotek, sposoben je sinhronizirati podatke, iskati dvojnike v sistemu. Directory Opus ima veliko število vtičnikov, ki pa jih v primerjavi s FAR ali Total Commander ni toliko. Program lahko samodejno posodablja in je na voljo za 32- in 64-bitne arhitekture sistema Windows. Aplikacijo lahko zaženete tudi iz bliskovnega pogona USB.
Druge možnosti vključujejo aplikacijo Double Commander s podporo vtičnika celotnega poveljnika. Obstajata tudi Unreal Commander in Speed Commander, ki praktično ponavljata funkcionalnost Total Commander, vendar imata nekoliko drugačno obliko in drevo nastavitev.